Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPB2P35606 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPB2P35606 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPB2P35606 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPB2P35606 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPB2P35606 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
COPB2P35606 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
COPB2P35606 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COPB2P35606 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPB2P35606 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPB2P35606 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPB2P35606 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPB2P35606 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPB2P35606 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPB2P35606 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPB2P35606 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPB2P35606 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPB2P35606 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPB2P35606 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPB2P35606 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPB2P35606 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPB2P35606 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPB2P35606 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPB2P35606 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPB2P35606 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPB2P35606 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPB2P35606 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPB2P35606 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
COPB2P35606 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPB2P35606 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPB2P35606 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPB2P35606 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPB2P35606 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPB2P35606 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPB2P35606 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPB2P35606 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPB2P35606 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPB2P35606 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COPB2P35606 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COPB2P35606 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COPB2P35606 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COPB2P35606 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COPB2P35606 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COPB2P35606 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COPB2P35606 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPB2P35606 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPB2P35606 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPB2P35606 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPB2P35606 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPB2P35606 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPB2P35606 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPB2P35606 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COPB2P35606 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPB2P35606 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPB2P35606 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COPB2P35606 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPB2P35606 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPB2P35606 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPB2P35606 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPB2P35606 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPB2P35606 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPB2P35606 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPB2P35606 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPB2P35606 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPB2P35606 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPB2P35606 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPB2P35606 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPB2P35606 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPB2P35606 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPB2P35606 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPB2P35606 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPB2P35606 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPB2P35606 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COPB2P35606 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COPB2P35606 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPB2P35606 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPB2P35606 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPB2P35606 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COPB2P35606 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COPB2P35606 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COPB2P35606 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPB2P35606 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPB2P35606 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPB2P35606 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COPB2P35606 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPB2P35606 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPB2P35606 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPB2P35606 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPB2P35606 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
COPB2P35606 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPB2P35606 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPB2P35606 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COPB2P35606 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COPB2P35606 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COPB2P35606 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COPB2P35606 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COPB2P35606 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COPB2P35606 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COPB2P35606 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COPB2P35606 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms