Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRA3P34903 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA3P34903 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA3P34903 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms