Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNA3P32297 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHRNA3P32297 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms