Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CPS1P31327 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CPS1P31327 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CPS1P31327 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CPS1P31327 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CPS1P31327 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CPS1P31327 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CPS1P31327 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CPS1P31327 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CPS1P31327 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CPS1P31327 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CPS1P31327 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CPS1P31327 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CPS1P31327 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CPS1P31327 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CPS1P31327 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CPS1P31327 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CPS1P31327 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CPS1P31327 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CPS1P31327 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CPS1P31327 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
CPS1P31327 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CPS1P31327 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CPS1P31327 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CPS1P31327 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CPS1P31327 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CPS1P31327 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CPS1P31327 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CPS1P31327 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CPS1P31327 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CPS1P31327 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CPS1P31327 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CPS1P31327 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CPS1P31327 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CPS1P31327 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CPS1P31327 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CPS1P31327 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CPS1P31327 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CPS1P31327 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CPS1P31327 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CPS1P31327 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CPS1P31327 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CPS1P31327 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CPS1P31327 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CPS1P31327 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CPS1P31327 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CPS1P31327 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CPS1P31327 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CPS1P31327 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CPS1P31327 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CPS1P31327 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CPS1P31327 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CPS1P31327 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CPS1P31327 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CPS1P31327 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CPS1P31327 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CPS1P31327 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CPS1P31327 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CPS1P31327 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CPS1P31327 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CPS1P31327 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CPS1P31327 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CPS1P31327 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CPS1P31327 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CPS1P31327 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CPS1P31327 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CPS1P31327 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CPS1P31327 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CPS1P31327 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CPS1P31327 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CPS1P31327 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CPS1P31327 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CPS1P31327 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CPS1P31327 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CPS1P31327 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CPS1P31327 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CPS1P31327 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CPS1P31327 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CPS1P31327 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CPS1P31327 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CPS1P31327 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CPS1P31327 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CPS1P31327 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CPS1P31327 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CPS1P31327 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CPS1P31327 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CPS1P31327 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CPS1P31327 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CPS1P31327 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CPS1P31327 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CPS1P31327 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CPS1P31327 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CPS1P31327 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CPS1P31327 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CPS1P31327 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
CPS1P31327 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CPS1P31327 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CPS1P31327 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CPS1P31327 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CPS1P31327 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms