Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TSPOP30536 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPOP30536 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPOP30536 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPOP30536 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPOP30536 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPOP30536 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPOP30536 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPOP30536 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPOP30536 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPOP30536 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPOP30536 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPOP30536 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPOP30536 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TSPOP30536 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPOP30536 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPOP30536 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPOP30536 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPOP30536 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPOP30536 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPOP30536 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPOP30536 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPOP30536 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPOP30536 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPOP30536 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPOP30536 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPOP30536 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPOP30536 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TSPOP30536 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPOP30536 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPOP30536 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPOP30536 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPOP30536 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPOP30536 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPOP30536 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPOP30536 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPOP30536 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPOP30536 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSPOP30536 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSPOP30536 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSPOP30536 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSPOP30536 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSPOP30536 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSPOP30536 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSPOP30536 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSPOP30536 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSPOP30536 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSPOP30536 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSPOP30536 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSPOP30536 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSPOP30536 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSPOP30536 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSPOP30536 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSPOP30536 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSPOP30536 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSPOP30536 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSPOP30536 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPOP30536 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPOP30536 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPOP30536 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPOP30536 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPOP30536 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPOP30536 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPOP30536 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPOP30536 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSPOP30536 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPOP30536 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPOP30536 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPOP30536 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPOP30536 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPOP30536 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPOP30536 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPOP30536 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPOP30536 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPOP30536 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPOP30536 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPOP30536 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPOP30536 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPOP30536 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPOP30536 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPOP30536 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPOP30536 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPOP30536 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPOP30536 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPOP30536 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPOP30536 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPOP30536 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPOP30536 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSPOP30536 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPOP30536 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPOP30536 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPOP30536 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPOP30536 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPOP30536 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPOP30536 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPOP30536 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPOP30536 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPOP30536 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPOP30536 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSPOP30536 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms