Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHA3P29320 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPHA3P29320 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms