Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFS1P28331 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFS1P28331 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFS1P28331 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms