Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POU1F1P28069 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU1F1P28069 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms