Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB9P28065 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms