Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMO2P25791 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMO2P25791 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMO2P25791 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMO2P25791 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMO2P25791 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMO2P25791 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMO2P25791 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMO2P25791 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO2P25791 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO2P25791 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO2P25791 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO2P25791 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO2P25791 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO2P25791 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO2P25791 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO2P25791 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO2P25791 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO2P25791 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO2P25791 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMO2P25791 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMO2P25791 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMO2P25791 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMO2P25791 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMO2P25791 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMO2P25791 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMO2P25791 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMO2P25791 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMO2P25791 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO2P25791 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO2P25791 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO2P25791 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO2P25791 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO2P25791 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMO2P25791 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMO2P25791 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMO2P25791 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMO2P25791 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO2P25791 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO2P25791 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO2P25791 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO2P25791 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO2P25791 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO2P25791 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO2P25791 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMO2P25791 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMO2P25791 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMO2P25791 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMO2P25791 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMO2P25791 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMO2P25791 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMO2P25791 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMO2P25791 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMO2P25791 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMO2P25791 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMO2P25791 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMO2P25791 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMO2P25791 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMO2P25791 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO2P25791 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO2P25791 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO2P25791 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO2P25791 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO2P25791 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO2P25791 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO2P25791 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO2P25791 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMO2P25791 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO2P25791 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO2P25791 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO2P25791 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO2P25791 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO2P25791 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMO2P25791 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO2P25791 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO2P25791 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO2P25791 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO2P25791 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO2P25791 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO2P25791 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO2P25791 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO2P25791 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMO2P25791 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO2P25791 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO2P25791 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO2P25791 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO2P25791 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMO2P25791 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO2P25791 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO2P25791 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO2P25791 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO2P25791 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO2P25791 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO2P25791 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO2P25791 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMO2P25791 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO2P25791 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO2P25791 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO2P25791 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMO2P25791 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms