Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR2AP24928 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR2AP24928 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR2AP24928 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR2AP24928 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms