Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5F1P24539 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5F1P24539 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms