Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDELR1P24390 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDELR1P24390 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDELR1P24390 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms