Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPS6KB1P23443 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KB1P23443 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms