Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AMPD1P23109 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMPD1P23109 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMPD1P23109 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms