Protein–RNA interactions for Protein: P21453

S1PR1, Sphingosine 1-phosphate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR1P21453 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1PR1P21453 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR1P21453 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms