Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN1P20061 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN1P20061 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN1P20061 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN1P20061 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN1P20061 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN1P20061 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN1P20061 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN1P20061 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCN1P20061 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCN1P20061 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCN1P20061 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCN1P20061 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCN1P20061 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCN1P20061 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCN1P20061 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCN1P20061 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCN1P20061 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCN1P20061 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCN1P20061 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCN1P20061 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCN1P20061 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCN1P20061 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCN1P20061 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCN1P20061 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN1P20061 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN1P20061 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN1P20061 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN1P20061 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN1P20061 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN1P20061 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN1P20061 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN1P20061 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN1P20061 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN1P20061 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN1P20061 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN1P20061 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCN1P20061 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCN1P20061 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCN1P20061 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCN1P20061 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCN1P20061 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN1P20061 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN1P20061 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN1P20061 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN1P20061 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCN1P20061 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN1P20061 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN1P20061 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN1P20061 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN1P20061 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN1P20061 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN1P20061 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN1P20061 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN1P20061 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN1P20061 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN1P20061 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN1P20061 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN1P20061 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN1P20061 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCN1P20061 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCN1P20061 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCN1P20061 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCN1P20061 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCN1P20061 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCN1P20061 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCN1P20061 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCN1P20061 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCN1P20061 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCN1P20061 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCN1P20061 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCN1P20061 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCN1P20061 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCN1P20061 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCN1P20061 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCN1P20061 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCN1P20061 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCN1P20061 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCN1P20061 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCN1P20061 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCN1P20061 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCN1P20061 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCN1P20061 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCN1P20061 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCN1P20061 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCN1P20061 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCN1P20061 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCN1P20061 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCN1P20061 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCN1P20061 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCN1P20061 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCN1P20061 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCN1P20061 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCN1P20061 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCN1P20061 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TCN1P20061 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCN1P20061 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCN1P20061 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCN1P20061 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCN1P20061 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms