Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFE3P19532 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFE3P19532 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFE3P19532 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFE3P19532 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFE3P19532 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFE3P19532 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFE3P19532 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFE3P19532 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFE3P19532 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFE3P19532 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFE3P19532 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFE3P19532 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFE3P19532 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFE3P19532 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TFE3P19532 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFE3P19532 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFE3P19532 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFE3P19532 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFE3P19532 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFE3P19532 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TFE3P19532 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TFE3P19532 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFE3P19532 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFE3P19532 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFE3P19532 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFE3P19532 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFE3P19532 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFE3P19532 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFE3P19532 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFE3P19532 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TFE3P19532 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFE3P19532 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFE3P19532 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFE3P19532 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFE3P19532 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFE3P19532 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TFE3P19532 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TFE3P19532 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFE3P19532 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFE3P19532 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFE3P19532 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFE3P19532 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFE3P19532 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFE3P19532 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFE3P19532 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFE3P19532 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFE3P19532 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFE3P19532 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFE3P19532 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFE3P19532 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFE3P19532 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TFE3P19532 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TFE3P19532 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TFE3P19532 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFE3P19532 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFE3P19532 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFE3P19532 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFE3P19532 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFE3P19532 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFE3P19532 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFE3P19532 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TFE3P19532 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFE3P19532 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFE3P19532 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFE3P19532 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFE3P19532 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFE3P19532 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFE3P19532 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFE3P19532 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFE3P19532 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFE3P19532 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFE3P19532 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFE3P19532 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TFE3P19532 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TFE3P19532 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TFE3P19532 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFE3P19532 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFE3P19532 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFE3P19532 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFE3P19532 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFE3P19532 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFE3P19532 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFE3P19532 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TFE3P19532 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFE3P19532 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFE3P19532 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFE3P19532 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFE3P19532 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFE3P19532 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFE3P19532 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFE3P19532 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFE3P19532 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TFE3P19532 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFE3P19532 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TFE3P19532 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFE3P19532 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TFE3P19532 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFE3P19532 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFE3P19532 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 703 ms