Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFEBP19484 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFEBP19484 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFEBP19484 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFEBP19484 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFEBP19484 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFEBP19484 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFEBP19484 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFEBP19484 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFEBP19484 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFEBP19484 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFEBP19484 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFEBP19484 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFEBP19484 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFEBP19484 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFEBP19484 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFEBP19484 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFEBP19484 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFEBP19484 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TFEBP19484 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFEBP19484 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFEBP19484 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TFEBP19484 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFEBP19484 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFEBP19484 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TFEBP19484 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TFEBP19484 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFEBP19484 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFEBP19484 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TFEBP19484 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFEBP19484 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFEBP19484 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFEBP19484 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFEBP19484 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFEBP19484 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFEBP19484 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFEBP19484 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFEBP19484 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFEBP19484 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFEBP19484 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFEBP19484 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFEBP19484 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFEBP19484 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFEBP19484 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFEBP19484 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFEBP19484 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFEBP19484 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFEBP19484 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFEBP19484 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFEBP19484 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFEBP19484 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFEBP19484 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFEBP19484 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TFEBP19484 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFEBP19484 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFEBP19484 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFEBP19484 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFEBP19484 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFEBP19484 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFEBP19484 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFEBP19484 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFEBP19484 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFEBP19484 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFEBP19484 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFEBP19484 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFEBP19484 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFEBP19484 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFEBP19484 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFEBP19484 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFEBP19484 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFEBP19484 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFEBP19484 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFEBP19484 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFEBP19484 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFEBP19484 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFEBP19484 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFEBP19484 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFEBP19484 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TFEBP19484 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFEBP19484 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFEBP19484 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFEBP19484 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFEBP19484 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TFEBP19484 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFEBP19484 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFEBP19484 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFEBP19484 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFEBP19484 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TFEBP19484 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFEBP19484 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFEBP19484 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFEBP19484 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFEBP19484 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFEBP19484 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFEBP19484 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFEBP19484 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFEBP19484 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFEBP19484 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFEBP19484 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFEBP19484 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms