Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VCAM1P19320 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VCAM1P19320 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
VCAM1P19320 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VCAM1P19320 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms