Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH2P19022 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH2P19022 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH2P19022 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH2P19022 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH2P19022 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH2P19022 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH2P19022 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH2P19022 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH2P19022 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH2P19022 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH2P19022 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH2P19022 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH2P19022 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH2P19022 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH2P19022 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH2P19022 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH2P19022 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH2P19022 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH2P19022 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH2P19022 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH2P19022 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH2P19022 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH2P19022 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH2P19022 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH2P19022 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH2P19022 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH2P19022 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH2P19022 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH2P19022 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH2P19022 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH2P19022 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH2P19022 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH2P19022 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH2P19022 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH2P19022 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH2P19022 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH2P19022 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH2P19022 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH2P19022 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH2P19022 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH2P19022 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH2P19022 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH2P19022 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH2P19022 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH2P19022 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH2P19022 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH2P19022 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH2P19022 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH2P19022 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH2P19022 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH2P19022 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH2P19022 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH2P19022 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH2P19022 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH2P19022 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH2P19022 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH2P19022 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH2P19022 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH2P19022 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH2P19022 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH2P19022 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH2P19022 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH2P19022 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH2P19022 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH2P19022 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH2P19022 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH2P19022 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH2P19022 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH2P19022 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH2P19022 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH2P19022 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH2P19022 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH2P19022 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH2P19022 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH2P19022 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH2P19022 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH2P19022 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH2P19022 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH2P19022 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH2P19022 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH2P19022 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH2P19022 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH2P19022 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH2P19022 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH2P19022 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH2P19022 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH2P19022 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH2P19022 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH2P19022 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH2P19022 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH2P19022 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH2P19022 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH2P19022 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH2P19022 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH2P19022 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH2P19022 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH2P19022 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH2P19022 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH2P19022 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms