Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT15P19012 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT15P19012 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT15P19012 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT15P19012 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT15P19012 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT15P19012 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT15P19012 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT15P19012 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT15P19012 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT15P19012 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT15P19012 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT15P19012 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT15P19012 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT15P19012 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT15P19012 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT15P19012 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT15P19012 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT15P19012 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT15P19012 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT15P19012 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT15P19012 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT15P19012 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT15P19012 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT15P19012 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT15P19012 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT15P19012 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT15P19012 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT15P19012 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT15P19012 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT15P19012 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT15P19012 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT15P19012 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT15P19012 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT15P19012 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT15P19012 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT15P19012 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT15P19012 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT15P19012 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT15P19012 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT15P19012 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT15P19012 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT15P19012 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT15P19012 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT15P19012 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT15P19012 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT15P19012 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT15P19012 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT15P19012 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT15P19012 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT15P19012 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT15P19012 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT15P19012 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT15P19012 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT15P19012 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT15P19012 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT15P19012 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT15P19012 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT15P19012 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT15P19012 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT15P19012 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT15P19012 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT15P19012 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT15P19012 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT15P19012 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT15P19012 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT15P19012 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT15P19012 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT15P19012 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT15P19012 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT15P19012 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT15P19012 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT15P19012 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT15P19012 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT15P19012 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT15P19012 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT15P19012 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT15P19012 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT15P19012 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT15P19012 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT15P19012 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT15P19012 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms