Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMD1P17707 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMD1P17707 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMD1P17707 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMD1P17707 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMD1P17707 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMD1P17707 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMD1P17707 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMD1P17707 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMD1P17707 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMD1P17707 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMD1P17707 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMD1P17707 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMD1P17707 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMD1P17707 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMD1P17707 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMD1P17707 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMD1P17707 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMD1P17707 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMD1P17707 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMD1P17707 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMD1P17707 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMD1P17707 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMD1P17707 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMD1P17707 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMD1P17707 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMD1P17707 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMD1P17707 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMD1P17707 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMD1P17707 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMD1P17707 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMD1P17707 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMD1P17707 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMD1P17707 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AMD1P17707 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMD1P17707 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMD1P17707 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMD1P17707 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMD1P17707 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMD1P17707 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMD1P17707 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMD1P17707 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMD1P17707 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMD1P17707 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMD1P17707 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMD1P17707 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMD1P17707 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMD1P17707 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMD1P17707 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMD1P17707 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMD1P17707 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMD1P17707 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMD1P17707 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMD1P17707 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMD1P17707 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMD1P17707 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMD1P17707 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMD1P17707 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMD1P17707 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMD1P17707 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMD1P17707 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMD1P17707 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMD1P17707 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AMD1P17707 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AMD1P17707 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMD1P17707 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMD1P17707 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMD1P17707 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMD1P17707 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMD1P17707 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMD1P17707 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMD1P17707 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AMD1P17707 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMD1P17707 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMD1P17707 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMD1P17707 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AMD1P17707 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMD1P17707 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMD1P17707 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMD1P17707 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMD1P17707 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMD1P17707 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AMD1P17707 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AMD1P17707 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AMD1P17707 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMD1P17707 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMD1P17707 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMD1P17707 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMD1P17707 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMD1P17707 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AMD1P17707 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AMD1P17707 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AMD1P17707 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMD1P17707 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AMD1P17707 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AMD1P17707 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMD1P17707 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMD1P17707 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMD1P17707 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AMD1P17707 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms