Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CKMT2P17540 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMT2P17540 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms