Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB9P17482 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB9P17482 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms