Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMPD1P17405 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMPD1P17405 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms