Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GOT1P17174 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOT1P17174 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOT1P17174 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOT1P17174 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOT1P17174 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOT1P17174 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOT1P17174 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOT1P17174 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOT1P17174 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOT1P17174 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOT1P17174 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOT1P17174 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOT1P17174 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOT1P17174 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOT1P17174 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOT1P17174 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOT1P17174 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOT1P17174 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOT1P17174 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1P17174 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1P17174 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1P17174 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1P17174 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1P17174 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1P17174 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1P17174 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1P17174 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1P17174 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1P17174 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOT1P17174 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOT1P17174 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOT1P17174 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOT1P17174 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOT1P17174 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOT1P17174 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOT1P17174 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOT1P17174 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOT1P17174 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOT1P17174 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOT1P17174 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOT1P17174 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOT1P17174 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOT1P17174 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOT1P17174 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GOT1P17174 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOT1P17174 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOT1P17174 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOT1P17174 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOT1P17174 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOT1P17174 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOT1P17174 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GOT1P17174 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOT1P17174 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOT1P17174 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOT1P17174 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOT1P17174 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOT1P17174 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOT1P17174 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOT1P17174 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GOT1P17174 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOT1P17174 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOT1P17174 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GOT1P17174 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOT1P17174 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOT1P17174 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1P17174 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1P17174 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1P17174 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1P17174 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1P17174 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1P17174 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1P17174 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1P17174 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1P17174 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1P17174 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1P17174 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1P17174 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOT1P17174 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOT1P17174 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOT1P17174 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GOT1P17174 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOT1P17174 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOT1P17174 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOT1P17174 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOT1P17174 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOT1P17174 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GOT1P17174 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOT1P17174 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOT1P17174 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOT1P17174 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOT1P17174 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOT1P17174 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOT1P17174 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOT1P17174 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOT1P17174 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOT1P17174 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOT1P17174 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOT1P17174 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOT1P17174 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms