Protein–RNA interactions for Protein: P17066

HSPA6, Heat shock 70 kDa protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA6P17066 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSPA6P17066 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA6P17066 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA6P17066 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HSPA6P17066 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HSPA6P17066 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms