Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCK1P16333 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCK1P16333 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCK1P16333 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCK1P16333 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCK1P16333 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCK1P16333 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCK1P16333 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCK1P16333 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCK1P16333 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCK1P16333 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCK1P16333 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCK1P16333 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCK1P16333 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCK1P16333 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCK1P16333 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCK1P16333 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCK1P16333 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCK1P16333 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCK1P16333 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCK1P16333 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCK1P16333 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCK1P16333 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCK1P16333 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCK1P16333 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCK1P16333 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCK1P16333 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCK1P16333 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCK1P16333 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCK1P16333 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCK1P16333 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCK1P16333 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCK1P16333 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCK1P16333 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCK1P16333 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCK1P16333 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCK1P16333 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCK1P16333 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCK1P16333 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCK1P16333 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCK1P16333 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCK1P16333 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCK1P16333 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCK1P16333 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCK1P16333 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCK1P16333 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCK1P16333 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCK1P16333 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCK1P16333 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCK1P16333 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCK1P16333 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCK1P16333 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCK1P16333 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCK1P16333 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCK1P16333 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCK1P16333 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCK1P16333 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCK1P16333 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCK1P16333 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCK1P16333 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCK1P16333 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCK1P16333 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCK1P16333 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCK1P16333 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCK1P16333 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCK1P16333 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCK1P16333 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCK1P16333 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCK1P16333 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCK1P16333 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCK1P16333 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCK1P16333 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCK1P16333 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCK1P16333 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCK1P16333 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCK1P16333 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCK1P16333 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCK1P16333 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms