Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRAP16234 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRAP16234 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDGFRAP16234 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms