Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSP16219 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACADSP16219 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSP16219 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSP16219 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSP16219 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSP16219 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSP16219 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSP16219 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSP16219 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACADSP16219 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSP16219 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSP16219 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSP16219 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSP16219 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSP16219 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSP16219 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACADSP16219 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSP16219 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSP16219 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSP16219 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSP16219 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSP16219 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSP16219 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSP16219 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSP16219 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACADSP16219 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSP16219 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSP16219 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSP16219 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSP16219 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSP16219 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSP16219 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSP16219 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSP16219 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSP16219 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACADSP16219 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACADSP16219 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACADSP16219 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACADSP16219 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACADSP16219 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSP16219 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSP16219 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSP16219 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSP16219 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSP16219 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSP16219 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSP16219 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACADSP16219 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACADSP16219 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACADSP16219 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACADSP16219 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACADSP16219 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSP16219 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSP16219 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSP16219 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSP16219 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSP16219 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSP16219 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSP16219 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACADSP16219 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSP16219 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSP16219 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSP16219 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSP16219 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSP16219 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSP16219 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACADSP16219 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSP16219 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSP16219 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSP16219 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSP16219 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSP16219 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSP16219 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSP16219 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSP16219 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACADSP16219 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSP16219 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSP16219 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSP16219 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSP16219 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACADSP16219 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACADSP16219 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACADSP16219 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms