Protein–RNA interactions for Protein: P16035

TIMP2, Metalloproteinase inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP2P16035 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TIMP2P16035 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIMP2P16035 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP2P16035 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms