Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MUC1P15941 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MUC1P15941 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MUC1P15941 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MUC1P15941 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MUC1P15941 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MUC1P15941 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MUC1P15941 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MUC1P15941 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MUC1P15941 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MUC1P15941 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MUC1P15941 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MUC1P15941 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MUC1P15941 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MUC1P15941 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MUC1P15941 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MUC1P15941 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MUC1P15941 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MUC1P15941 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MUC1P15941 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MUC1P15941 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MUC1P15941 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MUC1P15941 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MUC1P15941 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MUC1P15941 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MUC1P15941 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MUC1P15941 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MUC1P15941 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MUC1P15941 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MUC1P15941 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MUC1P15941 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MUC1P15941 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MUC1P15941 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MUC1P15941 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MUC1P15941 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MUC1P15941 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MUC1P15941 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MUC1P15941 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MUC1P15941 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MUC1P15941 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MUC1P15941 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MUC1P15941 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MUC1P15941 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MUC1P15941 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MUC1P15941 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MUC1P15941 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MUC1P15941 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MUC1P15941 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MUC1P15941 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MUC1P15941 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MUC1P15941 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MUC1P15941 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MUC1P15941 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MUC1P15941 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MUC1P15941 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MUC1P15941 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MUC1P15941 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MUC1P15941 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MUC1P15941 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MUC1P15941 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MUC1P15941 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MUC1P15941 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MUC1P15941 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MUC1P15941 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MUC1P15941 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MUC1P15941 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MUC1P15941 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MUC1P15941 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MUC1P15941 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MUC1P15941 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MUC1P15941 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MUC1P15941 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MUC1P15941 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MUC1P15941 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MUC1P15941 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MUC1P15941 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MUC1P15941 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MUC1P15941 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MUC1P15941 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MUC1P15941 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MUC1P15941 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MUC1P15941 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MUC1P15941 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MUC1P15941 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MUC1P15941 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MUC1P15941 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MUC1P15941 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MUC1P15941 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MUC1P15941 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MUC1P15941 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MUC1P15941 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MUC1P15941 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MUC1P15941 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MUC1P15941 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MUC1P15941 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MUC1P15941 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MUC1P15941 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MUC1P15941 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MUC1P15941 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MUC1P15941 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms