Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLS3P13797 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLS3P13797 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLS3P13797 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PLS3P13797 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLS3P13797 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLS3P13797 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLS3P13797 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLS3P13797 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLS3P13797 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLS3P13797 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLS3P13797 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PLS3P13797 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLS3P13797 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLS3P13797 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLS3P13797 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLS3P13797 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLS3P13797 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLS3P13797 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLS3P13797 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLS3P13797 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLS3P13797 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLS3P13797 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLS3P13797 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLS3P13797 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLS3P13797 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLS3P13797 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLS3P13797 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLS3P13797 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLS3P13797 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLS3P13797 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLS3P13797 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PLS3P13797 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLS3P13797 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLS3P13797 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLS3P13797 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLS3P13797 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLS3P13797 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLS3P13797 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLS3P13797 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLS3P13797 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLS3P13797 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLS3P13797 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLS3P13797 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLS3P13797 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLS3P13797 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLS3P13797 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLS3P13797 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLS3P13797 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLS3P13797 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLS3P13797 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLS3P13797 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLS3P13797 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PLS3P13797 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLS3P13797 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLS3P13797 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLS3P13797 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLS3P13797 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLS3P13797 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLS3P13797 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLS3P13797 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLS3P13797 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLS3P13797 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLS3P13797 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLS3P13797 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLS3P13797 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLS3P13797 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLS3P13797 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLS3P13797 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PLS3P13797 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLS3P13797 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLS3P13797 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLS3P13797 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLS3P13797 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLS3P13797 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLS3P13797 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLS3P13797 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLS3P13797 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLS3P13797 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLS3P13797 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLS3P13797 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLS3P13797 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLS3P13797 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLS3P13797 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PLS3P13797 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLS3P13797 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLS3P13797 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLS3P13797 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLS3P13797 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLS3P13797 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLS3P13797 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLS3P13797 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLS3P13797 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLS3P13797 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PLS3P13797 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLS3P13797 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLS3P13797 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLS3P13797 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLS3P13797 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLS3P13797 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms