Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF5P13349 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF5P13349 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF5P13349 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF5P13349 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF5P13349 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF5P13349 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF5P13349 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF5P13349 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF5P13349 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF5P13349 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF5P13349 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF5P13349 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF5P13349 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYF5P13349 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYF5P13349 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYF5P13349 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYF5P13349 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYF5P13349 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYF5P13349 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYF5P13349 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYF5P13349 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYF5P13349 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYF5P13349 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MYF5P13349 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYF5P13349 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYF5P13349 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYF5P13349 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYF5P13349 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYF5P13349 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MYF5P13349 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
MYF5P13349 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYF5P13349 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYF5P13349 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYF5P13349 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYF5P13349 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYF5P13349 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYF5P13349 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYF5P13349 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYF5P13349 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYF5P13349 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYF5P13349 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYF5P13349 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYF5P13349 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYF5P13349 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYF5P13349 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYF5P13349 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYF5P13349 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYF5P13349 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYF5P13349 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MYF5P13349 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYF5P13349 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYF5P13349 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYF5P13349 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYF5P13349 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYF5P13349 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYF5P13349 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYF5P13349 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYF5P13349 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYF5P13349 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYF5P13349 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYF5P13349 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYF5P13349 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYF5P13349 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYF5P13349 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYF5P13349 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYF5P13349 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYF5P13349 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYF5P13349 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYF5P13349 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYF5P13349 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MYF5P13349 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYF5P13349 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYF5P13349 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYF5P13349 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYF5P13349 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYF5P13349 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYF5P13349 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYF5P13349 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYF5P13349 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYF5P13349 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYF5P13349 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYF5P13349 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYF5P13349 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYF5P13349 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYF5P13349 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYF5P13349 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYF5P13349 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYF5P13349 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYF5P13349 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MYF5P13349 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYF5P13349 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYF5P13349 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MYF5P13349 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYF5P13349 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYF5P13349 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYF5P13349 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYF5P13349 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYF5P13349 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYF5P13349 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms