Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL6A2P12110 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL6A2P12110 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL6A2P12110 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL6A2P12110 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms