Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SFTPCP11686 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPCP11686 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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