Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNAT1P11488 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNAT1P11488 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GNAT1P11488 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.3 ms