Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ESRRAP11474 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ESRRAP11474 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESRRAP11474 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms