Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBL4AP11441 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBL4AP11441 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBL4AP11441 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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