Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
TOP2AP11388 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC42.62■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC42.6■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
TOP2AP11388 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC42.55■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
TOP2AP11388 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC42.51■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC42.48■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC42.47■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms