Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRFP10586 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRFP10586 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRFP10586 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms