Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HKR1P10072 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HKR1P10072 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HKR1P10072 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HKR1P10072 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HKR1P10072 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HKR1P10072 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HKR1P10072 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HKR1P10072 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HKR1P10072 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HKR1P10072 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HKR1P10072 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HKR1P10072 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HKR1P10072 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HKR1P10072 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HKR1P10072 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HKR1P10072 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HKR1P10072 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HKR1P10072 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HKR1P10072 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HKR1P10072 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HKR1P10072 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HKR1P10072 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HKR1P10072 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HKR1P10072 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HKR1P10072 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HKR1P10072 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HKR1P10072 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HKR1P10072 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HKR1P10072 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HKR1P10072 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HKR1P10072 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HKR1P10072 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HKR1P10072 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HKR1P10072 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HKR1P10072 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HKR1P10072 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HKR1P10072 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HKR1P10072 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HKR1P10072 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HKR1P10072 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HKR1P10072 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HKR1P10072 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HKR1P10072 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HKR1P10072 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HKR1P10072 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HKR1P10072 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HKR1P10072 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HKR1P10072 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HKR1P10072 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HKR1P10072 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HKR1P10072 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HKR1P10072 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HKR1P10072 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HKR1P10072 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HKR1P10072 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HKR1P10072 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HKR1P10072 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HKR1P10072 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HKR1P10072 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HKR1P10072 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HKR1P10072 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HKR1P10072 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HKR1P10072 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HKR1P10072 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HKR1P10072 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HKR1P10072 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HKR1P10072 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HKR1P10072 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HKR1P10072 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HKR1P10072 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HKR1P10072 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HKR1P10072 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HKR1P10072 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HKR1P10072 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HKR1P10072 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HKR1P10072 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HKR1P10072 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HKR1P10072 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HKR1P10072 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HKR1P10072 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HKR1P10072 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HKR1P10072 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HKR1P10072 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HKR1P10072 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HKR1P10072 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HKR1P10072 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HKR1P10072 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HKR1P10072 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HKR1P10072 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HKR1P10072 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HKR1P10072 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HKR1P10072 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HKR1P10072 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HKR1P10072 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HKR1P10072 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HKR1P10072 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HKR1P10072 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HKR1P10072 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HKR1P10072 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms