Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms