Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSH2P0DML3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSH2P0DML3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSH2P0DML3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms