Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2BP0DI82 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC2BP0DI82 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms