Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM228BP0C875 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM228BP0C875 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM228BP0C875 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM228BP0C875 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM228BP0C875 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM228BP0C875 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM228BP0C875 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM228BP0C875 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM228BP0C875 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM228BP0C875 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM228BP0C875 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM228BP0C875 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM228BP0C875 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM228BP0C875 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM228BP0C875 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM228BP0C875 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM228BP0C875 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms