Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP1P09455 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP1P09455 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP1P09455 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP1P09455 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP1P09455 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP1P09455 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP1P09455 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP1P09455 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBP1P09455 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP1P09455 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP1P09455 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP1P09455 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP1P09455 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP1P09455 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP1P09455 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBP1P09455 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP1P09455 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP1P09455 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP1P09455 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP1P09455 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP1P09455 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP1P09455 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP1P09455 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP1P09455 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP1P09455 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP1P09455 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBP1P09455 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP1P09455 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP1P09455 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP1P09455 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP1P09455 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP1P09455 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP1P09455 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP1P09455 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP1P09455 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP1P09455 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBP1P09455 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP1P09455 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP1P09455 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP1P09455 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP1P09455 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP1P09455 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP1P09455 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP1P09455 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP1P09455 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP1P09455 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP1P09455 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP1P09455 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP1P09455 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP1P09455 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP1P09455 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP1P09455 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP1P09455 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP1P09455 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP1P09455 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP1P09455 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP1P09455 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP1P09455 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP1P09455 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP1P09455 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP1P09455 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP1P09455 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP1P09455 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP1P09455 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP1P09455 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP1P09455 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP1P09455 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP1P09455 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP1P09455 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP1P09455 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP1P09455 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP1P09455 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBP1P09455 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP1P09455 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP1P09455 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP1P09455 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP1P09455 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP1P09455 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP1P09455 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP1P09455 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP1P09455 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP1P09455 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP1P09455 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP1P09455 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP1P09455 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP1P09455 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP1P09455 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP1P09455 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP1P09455 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP1P09455 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP1P09455 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP1P09455 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP1P09455 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP1P09455 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP1P09455 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP1P09455 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP1P09455 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP1P09455 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP1P09455 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms