Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD48P09326 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD48P09326 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD48P09326 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD48P09326 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD48P09326 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD48P09326 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD48P09326 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD48P09326 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD48P09326 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD48P09326 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD48P09326 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD48P09326 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD48P09326 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD48P09326 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD48P09326 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD48P09326 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD48P09326 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD48P09326 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD48P09326 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD48P09326 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD48P09326 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD48P09326 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD48P09326 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD48P09326 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CD48P09326 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD48P09326 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD48P09326 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD48P09326 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD48P09326 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD48P09326 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD48P09326 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD48P09326 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD48P09326 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD48P09326 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CD48P09326 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD48P09326 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD48P09326 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CD48P09326 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD48P09326 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CD48P09326 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD48P09326 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD48P09326 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD48P09326 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD48P09326 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD48P09326 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD48P09326 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD48P09326 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD48P09326 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CD48P09326 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD48P09326 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD48P09326 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD48P09326 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD48P09326 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD48P09326 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD48P09326 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD48P09326 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CD48P09326 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD48P09326 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD48P09326 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD48P09326 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD48P09326 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD48P09326 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD48P09326 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD48P09326 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD48P09326 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD48P09326 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD48P09326 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD48P09326 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD48P09326 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD48P09326 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD48P09326 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD48P09326 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD48P09326 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD48P09326 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD48P09326 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CD48P09326 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD48P09326 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD48P09326 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD48P09326 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CD48P09326 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD48P09326 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD48P09326 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD48P09326 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD48P09326 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD48P09326 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD48P09326 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD48P09326 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD48P09326 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD48P09326 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD48P09326 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD48P09326 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD48P09326 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD48P09326 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD48P09326 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD48P09326 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD48P09326 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD48P09326 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD48P09326 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD48P09326 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms