Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC4P09017 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC4P09017 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms